Plateforme d’électrophysiologie et imagerie fonctionnelle à ultrasons (ElfUS)

 

La plateforme ElfUS (électrophysiologie/imagerie fonctionnelle à ultrasons) est située au 3ème étage de l’Institut de Psychiatrie et Neurosciences de Paris (IPNP).

L’équipe est composée de Laurence Bourgeais (MCU, Université Paris Descartes, Responsable Scientifique) et Laurianne Beynac (IE, Université Paris Descartes).

 

Laurence Bourgeais

(MCU, Université Paris Descartes,

Responsable Scientifique)

Laurianne Beynac

(IE, Université Paris Descartes)

 

ElfUS est consacrée à la recherche dans le domaine des Neurosciences, par des approches électrophysiologiques combinées avec l’imagerie ultrasonique rapide, chez le rongeur. Elle bénéficie d’un retour technologique permanent assuré par une équipe d’experts dans le domaine des ultrasons. Cette équipe, dirigée par le Dr Mickael Tanter (Directeur de l’Unité Inserm U979 Wave Physics for Medicine), a mis au point une nouvelle technologie fUS permettant d’analyser la dynamique neurovasculaire cérébrale avec une très haute résolution spatiale et temporelle.

 

La plateforme supervise chaque étape de réalisation des projets, dès le dessin du protocole expérimental, incluant les expériences, la saisie, le traitement et enfin l’interprétation des données. ElfUS forme également le personnel qualifié pour participer aux expériences faites en interaction étroite avec l’équipe plateforme. Les projets sont évalués d’abord par notre Comité Scientifique de plateforme puis réalisés en fonction d’un calendrier.

 

ElfUS dispose de postes d’électrophysiologie pour des enregistrements extracellulaires in vivo chez la souris et le rat anesthésiés.

Un système miniaturisé de fUS ultrarapide permet l’acquisition, en temps réel, d’images 2D a haute résolution spatio-temporelle de l’ensemble du réseau micro-vasculaire du cerveau.

La plateforme est également équipée avec d’outils pour la stimulation sensorielle et la stimulation superficielle ou profonde du cerveau, ainsi que des systèmes de micro-injections intracérébrales.

ElfUS dispose aussi de postes pour l’enregistrement in vitro de tranches de cerveau (patch clamp, extracellulaire), utilisés exclusivement par du personnel qualifié.

 

Electrophysiologie in-vivo

Imagerie ultrasonore (fUS)

 

 

Voici quelques exemples d’activités proposées :

 

1 / Enregistrements extracellulaires et/ou de potentiels de champ in vivo des structures corticales, sous-corticales, du tronc cérébral ou de la moelle épinière chez le rongeur anesthésié.

 

2 / Enregistrements extracellulaires combinés avec la fUS ultrarapide en temps réel du système neurovasculaire, chez des modèles sains et pathologiques.

 

3 / Etudes de l’excitabilité cérébrale couplée à l’analyse des changements hémodynamiques provoqués par des stimulations sensorielles, manipulations pharmacologiques, dépression propagée, stimulations cérébrales superficielles ou profondes.

 

4 / Patch clamp et enregistrements extracellulaires in vitro sur des tranches de cerveau.

Introduction
Composition des Comités de Pilotage (CoPil)
Missions des comités de Pilotage
Règles générales d’accès à ElfUS
Systèmes disponibles
Accès aux pièces d’expérience
Facturation
Procédure de Formation
Procédure de Réservation
Sauvegarde des données
Règles d’utilisation du matériel
Généralités

1. Introduction



ElfUS est l’un des quatre plateformes technologiques de l’Institut de Psychiatrie et neurosciences de Paris (IPNP), localisé dans le 14ème arrondissement de Paris. Il évolue en collaboration directe avec l’INSERM, l’Université Paris Descartes et l’Hôpital Sainte-Anne.
L’accès à la plate-forme implique l’acceptation des règles et procédures définies par la plateforme et validées par le comité de direction de l’IPNP.


La plateforme ElfUS est sous la responsabilité d’une responsable scientifique et d’une responsable technologique. Un Comité de Pilotage (CoPil-ElfUS) est chargé de réfléchir à l’évolution de la plateforme. Il est composé de membres de la Direction de la Recherche, des responsables de la plateforme et de représentants des principales équipes utilisatrices. Un Comité de Pilotage Elargi (CoPil-ELfUS-e) intégrant les membres du CoPil-Elfus et les personnes de l’ART- INSERM U1273 « Ultrasons Biomédicaux » évaluera les projets incluant l’utilisation de l’imagerie fUS et les collaborations s’y rapportant.

2. Composition des Comités de Pilotage (CoPil)


Composition du Comité de Pilotage ElfUS (CoPil-ElfUS) :

Membres de la Direction de l’IPNP : Thierry Galli (Directeur de l’IPNP), Elisabeth Davenas(Secrétaire Générale de l’IPNP)
Membres de la plateforme ElfUS : Laurence Bourgeais (Responsable scientifique ElfUS), Laurianne Beynac (Responsable technologique ElfUS)
Représentants des équipes utilisatrices: Anne Joutel (Responsable de l’équipe Mécanismes physiopathogéniques des maladies des petits vaisseaux cérébraux),Zsolt Lenkei (Responsable de l’équipe Dynamique et structure neuronale),Jean-Charles Mariani(Dynamique et structure neuronale)

Composition du Comité de Pilotage Elargi ElfUS (CoPil-ElfUS-e) :

Membres de la Direction de l’IPNP : Thierry Galli (Directeur de l’IPNP), Elisabeth Davenas (Secrétaire Générale de l’IPNP)

Conditions générales ElfUS version au 1er juin 2019
Membres de la plateforme ElfUS: Laurence Bourgeais (Responsable scientifique ElfUS) : Laurianne Beynac (Responsable technologique ElfUS)
Représentants des équipes utilisatrices: Anne Joutel (Responsable de l’équipe Mécanismes physiopathogéniques des maladies des petits vaisseaux cérébraux), Zsolt Lenkei (Responsable de l’équipe Dynamique et structure neuronale), Jean-Charles Mariani(Dynamique et structure neuronale)
Membres de l’ART – U1273 « Ultrasons Biomédicaux », Mickaël Tanter (Directeur de Physics for medecine Paris), Thu-Mai Nguyen (Chef de projet scientifique de l’ART INSERM), Clément Papadacci (Coordinateur scientifique ART INSERM)

3 Missions des comités de Pilotage


Mission du CoPil-ElfUS

Définir les conditions de fonctionnement interne et externe de la plateforme
Adopter/modifier le règlement intérieur
Définir les tarifs
Assurer le suivi des problèmes techniques
Assurer le suivi des achats de matériels
Valider les projets internes

Missions du CoPil-ElfUS-e
Evaluation des projets menés sur ElfUS nécessitant l’utilisation de l’imagerie fUS
Suivi des signatures dans les publications scientifiques
Suivi du développement technologique lié aux imageurs fUS
Suivi du développement lié à l’analyse des données fUS


4. Règles générales d’accès à ElfUS

4.1. Localisation


ElfUS est localisé au premier et troisième étage de l’IPNP, 102-108 rue de la santé, 75014, Paris.
Accès
→    Métro ligne 6 : Arrêt Glacière
→    Tramway ligne 3 : Arrêt Cité Universitaire
→    RER B : Arrêt Cité Universitaire
→    Bus n°21 : Arrêt Glacière Tolbiac
→    Bus n°62 : Arrêt Glacière Tolbiac
→    Bus n°88 : Arrêt Glacière Tolbiac
→    Bus n°216 : Arrêt Glacière Tolbiac
→    Bus Orly-bus : Arrêt Glacière Tolbiac

4.2. Horaires d’accès


L’accès des utilisateurs externes est autorisé de 9h à 17h30, du Lundi au Vendredi. Pour les agents de l’IPNP les horaires sont déterminés par les règles d’accès à l’IPNP, à savoir du Lundi au Vendredi de 8h00 à 20h00.


4.3. Conditions générales d’utilisation


L’utilisateur s’engage à posséder tous les documents réglementaires qui autorisent l’utilisation de ses animaux, notamment les agréments OGM et l’agrément du comité d’éthique.

 

5. Systèmes disponibles

Au premier étage de l’IPNP, se trouve le système d’imagerie fUS dédié aux enregistrements chroniques et/ou éveillés (pièce 132).

Au troisième étage de l’IPNP, se trouvent :
• Le système d’enregistrement électrophysiologique extracellulaire in-vivo (pièce 321)
• Le système d’imagerie fUS (pièce 321)
Les systèmes d’imagerie fUS sont complétés chacun d’un ordinateur d’analyse online de données. Un ordinateur d’analyse des signaux fUS et électrophysiologiques est localisé dans la pièce de bio-informatique.


6. Accès aux pièces d’expérience et à la salle de bio-informatique


Les portes des pièces 123, 321 et de bio-informatique sont équipées de lecteurs de badges.


7. Facturation


Le détail des conditions de facturation est disponible sur le Site intene de l'IPNP


8. Procédure de Formation

 

8.1. Informations générales


Au préalable de toute formation, la charte d’utilisation de la plateforme devra être signée par l’utilisateur. Si un membre d’une équipe est responsable d’une « casse » de matériel de la plateforme, l’équipe en question devra payer le prix nécessaire à sa remise en état.
Afin de s’assurer de la bonne utilisation des systèmes, il est recommandé de procéder à la formation seulement une fois votre projet de recherche clairement défini.
La formation sera facturée au prix d’une heure d’utilisation du système en question.
Les utilisateurs sont invités à contacter la plateforme afin de s’assurer de la compatibilité de leurs expériences avec le matériel.


8.2. Pour faire une demande de formation :


Pour toute demande de formation, contactez la plateforme par mail à elfus-u1266@inserm.fr
La plateforme est ouverte aux utilisateurs externes. Ces derniers doivent préalablement soumettre une demande de collaboration.


9. Procédure de Réservation

9.1. Informations générales


La réservation des systèmes est libre, cependant elle ne sera autorisée que si les responsables de la plateforme sont assurées de la capacité des utilisateurs à s’en servir.
Les créneaux de réservations sont maintenus jusqu’à 30 minutes après le début de l’horaire prévu. Au-delà de cette durée, si l’utilisateur n’est pas en train d’utiliser le système, la réservation est annulée et de nouveau disponible pour les autres utilisateurs. Le créneau sera tout de même facturé sauf si la plateforme parvient à trouver un utilisateur pouvant exploiter le créneau en question.
En cas de non-respect des conditions de réservation, l’équipe de la plateforme ElfUS seréserve le droit d’annuler la réservation sans notification ni avertissement préalable. Aussi, les utilisateurs sont priés de ne pas réserver les systèmes de manière inconsidérée.


9.2. Demande de réservation

La réservation des appareils est obligatoire et se fait en ligne via le site Intranet de l’IPNP
L’accès Intranet étant réservé aux membres de l’IPNP, les utilisateurs ne pouvant pas s’y connecter sont priés de contacter la plateforme à elfus-1266@inserm.fr
Toute annulation devra faire l’objet d’un mail à elfus-u1266@inserm.fr


10. Sauvegarde des données


Tous les systèmes de la plateforme ElfUS seront à terme reliés au réseau interne de l’IPNP. La sauvegarde des données devra donc se réaliser via ce réseau.
Afin de faciliter le stockage des données, pour chaque utilisation, les utilisateurs sont priés de sauvegarder leurs expériences dans un dossier « équipe » ainsi qu’un sous dossier « Prénom NOM ».
Afin d’éviter la saturation des disques durs des postes d’acquisitions, les utilisateurs sont priés d’exporter leurs données et de les stocker sur leur poste personnel. Ainsi le personnel de la plateforme se réserve le droit, si nécessaire, de supprimer toute expérience stockée sur les disques durs des postes d’acquisitions ou de traitement d’images sans notification ni avertissement préalable.
Des interventions de sauvegarde de routine des données seront réalisées par l’équipe de la plateforme après avoir avertis les utilisateurs et leur avoir laissé un délai d’intervention suffisant pour sauvegarder les données sur un support de stockage externe.
La plateforme ElfUS s’engage à stocker de manière sécuritaire toute donnée pendant une durée de 30 jours, passé ce délai, l’accès aux données n’est plus garanti.


11. Règles d’utilisation du matériel

11.1. Matériel informatique


Les utilisateurs doivent utiliser les sessions utilisateurs des différents postes d’acquisition ou de traitement de données. Il leur est interdit d’installer, désinstaller ou procéder à des mises à jour de logiciels sans la permission expresse du personnel de la plateforme.
Les utilisateurs ne sont pas non plus autorisés à consulter ou utiliser sans autorisation des fichiers ou données qui ne leur appartiennent pas.
Conditions générales ElfUS version au 1er juin 2019
Afin de garantir l’intégrité des systèmes informatiques de la plateforme, nous demandons aux utilisateurs de ne pas introduire de clefs USB potentiellement infectées sur les postes d’acquisition.
La plateforme d’imagerie ne saurait être tenue pour responsable de la transmission de virus informatiques et autres éléments nuisibles au bon fonctionnement du matériel informatique de la plateforme.


11.2. Confidentialité des données


Les images et données obtenues grâce aux systèmes de la plateforme ElfUS sont la propriété des équipes qui les ont réalisés ainsi que de l’INSERM et obéissent en tous points aux règles et usages relatifs à la propriété intellectuelle.
Les membres de la plateforme ne sont d’ailleurs pas autorisés à communiquer sur les thèmes de recherche des utilisateurs sans l’accord des équipes.


12. Généralités


La mention de la plateforme ou de ses agents dans des publications permet de mettre en évidence leur utilité et le bienfondé de leur présence dans la communauté scientifique. Ceci facilite d’autant la demande de financement pour investir dans nouveaux appareils et de nouvelles ressources.


12.1. Mention de la plateforme

Pour valoriser l’activité de la plateforme et favoriser son développement, il est indispensable que son activité soit explicitement reconnue. Lorsque la participation de la plateforme a été décisive, l’ingénieure impliquée et le responsable de la plateforme doivent être co-signataires.
Sinon cette reconnaissance doit se traduire, dans les publications, par les mentions « data acquisition and/or data analysis were performed on the IPNP ElfUS core facility » dans la rubrique Materiels & Methods, et « the authors greatly acknowlegde _________ of the IPNP ElfUS core facility » dans les remerciements.
Merci également de nous indiquer les références des publications incluant les données obtenues grâce à la plateforme.Fforme

 

 

Laurence Bourgeais-Rambur (Laurence.bourgeais@inserm.fr ; +33 1 40 78 92 55)

 

Laurianne Beynac (laurianne.beynac@inserm.fr ; +33 1 40 78 92 55)